Das bisherige Kirchengebäude in der Waldstraße 3 in Breisach wurde 1960 fertiggestellt und mehrmals renoviert bzw. umgebaut.
Es entspricht jedoch nicht mehr den heutigen Anforderungen, beispielsweise was die Nebenräume betrifft. Die Gemeinde ist außerdem im Juli 2017 durch die Fusion mit den Mitgliedern der früheren Kirchengemeinde Vogtsburg-Bischoffingen gewachsen.
In den nächsten Wochen beginnt daher der Abriss des bisherigen Gebäudes und es wird mit einem Neubau am gleichen Platz begonnen. Das neue Kirchengebäude soll neben dem Kirchensaal für rund 80 Gottesdienstbesucher mehrere, flexibel verwendbare Nebenräume erhalten, welche z.B. für die parallel zum Sonntagsgottesdienst stattfindende Sonntagsschule für die Kinder dienen. Außerdem stehen diese auch für Zusammenkünfte verschiedener Altersgruppen zur Verfügung oder für Gemeindefeste. Alle Räume sollen barrierefrei erreichbar sein.
Am Mittwoch, dem 28. Februar fand der letzte Gottesdienst im alten Kirchengebäude statt, den der Bezirksvorsteher Karl-Friedrich Braun durchführte. Er erinnerte an die vielen besonderen Gottesdienste, welche in diesem Gotteshaus stattfanden.
Ab Sonntag, den 4. März finden vorübergehend die neuapostolischen Gottesdienste in der Kapelle St. Verena in Breisach-Hochstetten im Kirchweg statt, welche von der Katholischen Kirche für die Zeit der Bauarbeiten dankenswerter Weise zur Verfügung gestellt wird.